银杏植物的历史可以追溯到大约3亿年前的石炭纪。大多数人认为，北美洲出土的距今3亿年的化石Dichophy-llum可能是银杏的远祖。它的叶子扁平，像小树枝一样，像经历了许多深裂缝的银杏叶，但它的生殖器官是未知的。
弗洛林（Florin）对大量银杏化石做过深入研究，尤其将二叠纪早期的毛叶（）与现代银杏的雌性器官进行比较，认为毛叶是更可靠的原始物。银杏。它的叶子比分叉的叶子更细长，种子（胚珠）以下垂的方式生长在从叶腋抽出的树枝上。这个假说并没有被大家接受，因为虽然毛叶比双歧叶更像银杏叶，但现代银杏的原位胚珠是否是由毛叶倒置的胚珠进化而来的，目前还缺乏证据。一般认为原位胚珠比倒置胚珠更原始。
出现在二叠纪的楔白拉()也被公认为另一种原始银杏。它与现代银杏在叶片形态上的主要区别在于它没有明显的叶柄。
侏罗纪之前，世界上银杏植物种类不多，分布有限，银杏植物发展相对缓慢。从侏罗纪开始，地球上的气候先是温暖湿润，然后逐渐变得干旱，造成了银杏植物的急剧分化。从侏罗纪中晚期到白垩纪早期，银杏树种达到了地球上繁盛的顶峰。它们不仅种类很多，而且地理分布也很广。除了赤道和南极洲，几乎所有的银杏树种都可以看到。有人估计，在侏罗纪安联时期，河北、北京、辽宁、山西至陕西一带，约30%的植物为银杏。
根据化石资料分析，全盛期世界上至少有20多个银杏属。仅在银杏属和伪银杏属中，世界上已描述了200多种。我国已发现十多个属、一百多个种，约占世界总数的三分之一。
在植物化石的研究中，所有具有严格分叉模式的叶脉和叶脉细胞都明显拉长，这都归功于银杏。然而，这些植物中有许多与现代银杏有很大不同，它们仅代表与银杏相关的少数在进化过程中已经灭绝的分支。至于Tskanye属，经过Harria详细研究，证实它的雌性生殖器官是细耳()，即在细长的轴上，生出一排由两片花瓣组成的。果荚，每个有5个椭圆形倒置胚珠（种子）。这种结构与银杏明显不同，与极其原始的被子植物非常相似。为此，Pant() 建立了 Gekanows-kiales 的命令，与 Ginkgo 的命令平行。经过多位学者的研究，
白垩纪末期，银杏品种突然减少。这种下降主要是由于其对土壤和气候的高要求，尤其是对土壤水分和空气湿度的高要求，再加上自身的扩散能力低，在经历了许多冰川的毁灭性打击后，再也无法起死回生。 . 被子植物的兴起也是银杏不能迅速占据冰期失去的分布范围的重要原因。
经研究，银杏叶与现代银杏无明显区别。Manapehko对银杏的研究证明了气候条件对银杏植物分布的限制和影响。
蕨叶银杏起源于古老的安加拉大陆，即位于北纬40度左右的东亚地区。它沿着起源中心向东和向西传播。从侏罗纪末期到白垩纪初，随着气候变化较小，银杏的分布面积几乎翻了两番，使该物种从瑞典格陵兰岛，经西伯利亚传播到北美。第三纪初期，北美气候变暖，蕨叶和银杏叶也扩大植物活化石是泠杉树吗，明显向北移动。渐新世和中新世时期，整个欧亚大陆和北美洲气候变冷，分布区域也随之南移。在上新世之前，它到达了不列颠哥伦比亚省，并在欧洲到达了谢里塔马克（巴什基里亚）。它只是在上新世中期从北美消失了。当时，法国南部仍有一小块孤立的分布区，被第四纪冰川冲走。只有东亚，一个没有完全被冰川覆盖，气候变化最小的地方，银杏才能免于灭绝。当今世界所见的银杏树，是一种历经亿万年的植物植物活化石是泠杉树吗，因此被称为“活化石”。
