苗木出圃是育苗中的最后一个环节，也是容易出问题的步骤。嫁接过程中各品种虽分的较清，挖起苗过程中却很容易混淆。另外，起苗后的根系保护很容易被忽视，保护不好容易造成根系失水，从而影响苗木生长甚至成活。尤其大型苗圃，起苗前应该做好各方面的准备工作和人员组织安排，和以保证苗木正常出圃。
(1)出圃时间。苗木出圃在秋末苗木落叶后，或开始落叶时就可以起苗出圃，至土壤上冻前起苗，越晚越好。出圃后进行苗木假植贮藏。也可在春季土壤解冻后萌芽前起苗出圃，随出圃随栽最好。起苗最好选择阴天，或在早、晚进行。大风天气苗木易失水过多，会影响栽植的成活率和幼树的生长势。
(2)出圃前的准备。①品种核对起苗前应对照嫁接品种记录和品种表现特征认真核对，分片挂标签，如因补接等原因品种较乱时，应每株都挂上标签。标签上注明品种、砧木、产地等以避免苗木品种发生混淆。②浇水起苗前一周左右，应灌一次水使土壤松软，减少根系的损伤，减少劳动强度，提高工作效率。也可增加苗木含水量，提高成活率。③去叶片如起苗时叶片尚未脱落，应先把叶片全部去掉以减少水分蒸发。④贮存场所预先把苗木贮藏场平整好，等苗木运到后应立即按品种、质量分开贮藏。
(3)起苗。梨树实生苗的垂直根发达，侧根少且深，为保持根系完整，起苗应比苹果等树种挖得深，且多带土。起苗时，先于苗圃边行外侧开沟，深达30厘米左右，铲断底部主根后，然后逐行逐棵挖掘。要尽量较完整地挖起根系，少伤根，多保留须根，以利于提高栽植后的成活率。起苗时应注意保护接芽(半成苗)或接口部，使其免受伤害。为保证苗木新鲜，挖出的苗木要立即在地边用湿土将根系埋住，避免风吹日晒，待整块地的苗木起完后及时运出，一起进行假植贮藏。
